治疗结束后协商赔偿事宜，协商不成的，直接向法院起诉。
根据法律规定，在上下班途中发生交通事故且在事故当中不负主要责任或全责的，可以申请工伤认定，主张工伤保险待遇。由于交通事故属于侵权法律关系，还可以向对方主张赔偿。
