在同程旅游订机票时，如果台湾通行证号填错了，可以采取以下步骤进行修改：
1. 立即联系同程旅游的客服，告知他们台湾通行证号填错的事实。
2. 客服人员会要求你提供正确的台湾通行证号。
3. 客服人员会查核你的订票记录，确认是否已经出票，以及是否在飞机起飞前还有修改信息的时间。
4. 如果尚未出票，他们可以在系统中帮你修改台湾通行证号。
5. 如果已经出票，客服人员也会尽可能帮你修改，但具体能否成功修改要取决于航空公司的政策。
需要注意的是，如果你在机场或者登机时发现台湾通行证号有误，可能无法登机。因此，建议在发现错误后尽快联系同程旅游客服，并尽量在飞机起飞前完成修改。
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