A、反应前的两个分子构成相同属于同一种分子,因此反应物为一种物质;生成的三个分子中,其中有两个分子构成相同为同种分子,而另一种分子的构成与这两个分子不同,属于另一种物质的分子,因此,生成物为两种物质;一种物质反应后生成两种物质的反应为分解反应而不是化合反应;故A不正确;
B、反应前水分子由氢、氧原子构成;反应生成的氢气分子、氧气分子分别则氢原子和氧原子构成;因此,反应前后原子种类没变,可确定反应前后元素种类不变;故B正确;
C、由微观示意图可发现,在变化前后原子没有改变,变化过程只是原子重新组合成新的分子的过程;因此,化学变化过中原子是最小的微粒;故C正确;
D、由微观示意图可知,反应前是水分子,反应后生成的是氢分子、氧分子,故水分子反应后变成氢分子和氧分子的说法正确;故D正确;
答案:A.