彩椒烂根一般是由腐皮镰孢根腐病和疫霉根腐病引起，辣椒的根部皮层变为淡褐色至深褐色腐烂，呈糟糠状。辣椒得病后表现为白天萎蔫，早晚恢复，这样反复几天后辣椒出现死亡。根腐病主要通过水流传播，注意不要通过浇水传播，同时也可用58%金雷多米尔500倍液+72.2%普力克600倍液进行灌根防治，效果较好。
