说的好听点是毁誉参半，说的难听点是遗臭万年，往小了说是明朝的罪人。往大了说是中华民族的罪人。
朱翊钧在位初之十年，内阁首辅张居正主持政务，在神宗支持下实行了一系列改革措施，社会经济有很大的发展，国力得到恢复，人民生活也有所提高。神宗亲政后，励精图治、生活节俭，有勤勉明君之风范，开创了“万历中兴”的局面。期间主持了著名的万历三大征，巩固了汉家疆土。执政后期荒于政事，因无像张居正的人可以督导、国本之争等问题而倦于朝政，自此不上朝，国家运转几乎停摆，强征矿税亦是在位期间被称为一大诟病，使明朝逐渐走向衰亡。
在此还需说明一点，1956年-1957年中国考古工作者对明神宗的定陵地下玄宫进行了发掘，通过对明神宗朱翊钧尸骨的检验，发现他居然是长短腿，天生残疾。这也在一定程度上影响了他处理朝政。
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