|x-1|+|x-3|表示数轴上的x对应点到1和3对应点的距离之和,其最小值等于2,由题意|x-1|+|x-3|≤a2-2a-1的解集为空集,可得|x-1|+|x-3|>a2-2a-1恒成立,故有2>a2-2a-1,解得-1<a<3,故选:C.