非在本县农合定点医院住院治疗的，住院前或住院后3天内应当到当地农合办办理转诊手续，经农合办批准后才能在批准的医院治疗，治疗结束后到当地农合办办理报销。需要携带转诊审批单、农合本、身份证、户口本、住院病历、住院证、诊断证明、住院发票、费用清单和银行卡或存折。农合报销金额根据就诊医院的等级、自费药品的使用等扣除报销起点费用后按比例报销。在北京的医院治疗回老家的农合办报销，比例一般都比较低。
如果在外地医院住院前没有在农合办办理转诊手续，农合办原则上不予报销。
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